La institución cuenta con un currículo sólido basado en el programa regular del Departamento de Educación de Puerto Rico. El mismo es uno altamente elaborado y modificado de acuerdo a las necesidades individuales de cada estudiante, que permiten la integración de elementos que fortalecen cada una de las áreas: español, matemáticas, ciencias, estudios sociales, inglés, educación física, música, computadoras, arte y teatro. Los currículos de estas asignaturas se complementan con libros de texto actualizados y con módulos, los cuales son revisados por los miembros de la facultad a través del año académico. Además, se acompaña el programa general con otros ofrecimientos que estimulan el aprovechamiento académico, y el bienestar social y emocional de los estudiantes, tales como coro de campanas, banda, organizaciones estudiantiles, equipos de baloncesto, equipos de voleibol, círculo de literatura y consejo estudiantil.

IMEI cuenta con los servicios terapéuticos integrados al programa educativo. Su objetivo es fortalecer y garantizar un proceso de enseñanza-aprendizaje de excelencia. Además, se llevan a cabo evaluaciones y tratamientos con el propósito de diagnosticar e identificar las áreas de fortalezas y necesidades en términos académicos y clínicos. Entre los profesionales que atienden a la población estudiantil se encuentran Terapeutas ocupacionales, educativos y del habla, Patólogos del habla, Psicólogos escolares y clínicos y Trabajadora social.

El programa académico (regular y especial) ha disfrutado de un incremento en el ofrecimiento de clases y herramientas con el propósito de ofrecer a los estudiantes una programación que se adapte a sus necesidades. Los programas y servicios se establecen en coordinación con el hogar y el equipo multidisciplinario.

Título I: Ofrece servicios educativos remediativos.
Clases especiales: Brinda ayuda adicional a estudiantes con rezagos en las materias básicas.
Estudios supervisados: Se supervisa la ejecutoria académica, y fomenta el desarrollo de la independencia en el estudiante.
Cuido (mañana y tarde): Garantiza el bienestar y seguridad del estudiante fuera del horario regular de clases.
Comedor escolar: Ofrece alimentos nutritivos de acuerdo a la dieta preparada por especialistas de la salud en coordinación con el Programa de Comedores Escolares del Departamento de Educación.
Modelaje (servicio externo): Se ofrece en horario extendido a solicitud de los padres como complemento a la clase de música del horario regular.
Clínicas de baloncesto y volibol: Se ofrecen en horario extendido.